Amministratore di società private di servizi alle imprese e revisore contabile per molte imprese, come la PricewaterhouseCoopers di Milano, ha anche rivestito ruoli prestigiosi in diverse aziende. Giuseppe Pasqualone ha inoltre una esperienza significativa in aziende pubbliche. È stato infatti Direttore Finanziario e del Controllo di Gestione della ASL BA/2 di Barletta, Amministratore Unico della SANITASERVICE ASL BT S.r.l. e Direttore Generale per due mandati della Azienda Sanitaria Locale della Provincia di Brindisi.
Attualmente è alla guida del Policlinico Riuniti di Foggia, in qualità di Direttore Generale.