Nel 1997, con Capelli, vince il Premio della Critica nelle Nuove Proposte al Festival di Sanremo. Nel 1998 presenta, sempre a Sanremo, Lasciarsi un giorno a Roma, contenuto nell’album Niccolò Fabi. Tra il 2000 e il 2006, pubblica Sereno ad Ovest, La Cura del Tempo e Novo Mesto, che comprende Costruire, diventata negli anni uno dei suoi brani più identificativi e più amati. Tre anni dopo pubblica Solo un Uomo. Il 30 agosto 2010 organizza al Casale sul Treja, a Mazzano Romano, Parole di Lulù, la festa di compleanno per la figlia Olivia, scomparsa a seguito di una forma acuta di meningite. In questa occasione, vengono raccolti i fondi a favore di Medici con l’Africa CUAMM. Nel 2010, viene pubblicato il singolo Parole Parole, cantato insieme a Mina. Nel 2012, Ecco, disco che vincerà la Targa Tenco come miglior disco in assoluto.
Il 2014 e il 2015 sono gli anni di FabiSilvestriGazzè.
Nel 2017, festeggia i 20 anni di carriera con l’uscita di Diventi Inventi 1997-2017. Nel 2019 viene rilasciata Io Sono l’altro, primo brano estratto da Tradizione e Tradimento, il suo nuovo album, prodotto insieme a Roberto Angelini e Pier Cortese, con cui consegue il Premio Amnesty 2020 Voci per la Libertà. Poi è la volta del disco speciale Meno per Meno, con il brano Andare Oltre, che ottiene il premio come miglior videoclip del 2022 alla Festa del Cinema di Roma. Ad ottobre 2024, il cantautore partecipa al progetto “Discoverland”, un tour nei club d’Italia, per la prima volta sul palco solo in veste di musicista.